Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXA2

Vmn1r11, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r11Q3SXA2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r11Q3SXA2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r11Q3SXA2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vmn1r11Q3SXA2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r11Q3SXA2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r11Q3SXA2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r11Q3SXA2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r11Q3SXA2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r11Q3SXA2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r11Q3SXA2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r11Q3SXA2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r11Q3SXA2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r11Q3SXA2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r11Q3SXA2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r11Q3SXA2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r11Q3SXA2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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