Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cers3Q1A3B0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cers3Q1A3B0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cers3Q1A3B0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cers3Q1A3B0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cers3Q1A3B0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cers3Q1A3B0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cers3Q1A3B0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cers3Q1A3B0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cers3Q1A3B0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cers3Q1A3B0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cers3Q1A3B0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cers3Q1A3B0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cers3Q1A3B0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cers3Q1A3B0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cers3Q1A3B0 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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