Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
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