Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Traf3ip1Q149C2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms