Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VgfQ0VGU4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms