Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Samd12Q0VE29 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms