Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms