Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Itgb8Q0VBD0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Itgb8Q0VBD0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms