Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kcnb1Q03717 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kcnb1Q03717 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kcnb1Q03717 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kcnb1Q03717 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kcnb1Q03717 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kcnb1Q03717 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnb1Q03717 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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