Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Msx2Q03358 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms