Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gjb4Q02738 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms