Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Nme2Q01768 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nme2Q01768 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms