Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rbp4Q00724 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms