Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
F8a1Q00558 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms