Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Stx2Q00262 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms