Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shc1P98083 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shc1P98083 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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