Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms