Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H3f3aP84244 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms