Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ElocP83940 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ElocP83940 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ElocP83940 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ElocP83940 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ElocP83940 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ElocP83940 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ElocP83940 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ElocP83940 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
ElocP83940 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ElocP83940 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ElocP83940 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ElocP83940 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ElocP83940 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ElocP83940 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
ElocP83940 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ElocP83940 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ElocP83940 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms