Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Irx1P81068 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms