Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms