Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SbdsP70122 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SbdsP70122 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms