Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms