Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ufm1P61961 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms