Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Taf13P61216 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Taf13P61216 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Taf13P61216 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Taf13P61216 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Taf13P61216 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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