Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HccsP53702 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HccsP53702 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HccsP53702 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HccsP53702 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HccsP53702 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HccsP53702 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HccsP53702 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HccsP53702 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HccsP53702 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HccsP53702 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HccsP53702 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HccsP53702 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HccsP53702 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HccsP53702 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HccsP53702 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms