Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PtpreP49446 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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PtpreP49446 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PtpreP49446 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PtpreP49446 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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