Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VdrP48281 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VdrP48281 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms