Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PtgfrP43117 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtgfrP43117 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms