Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
NodalP43021 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NodalP43021 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NodalP43021 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NodalP43021 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NodalP43021 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
NodalP43021 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NodalP43021 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
NodalP43021 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
NodalP43021 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NodalP43021 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NodalP43021 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
NodalP43021 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
NodalP43021 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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