Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Timp3P39876 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms