Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TtlP38585 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TtlP38585 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TtlP38585 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TtlP38585 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TtlP38585 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TtlP38585 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TtlP38585 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtlP38585 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms