Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Nedd1P33215 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Nedd1P33215 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Nedd1P33215 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Nedd1P33215 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Nedd1P33215 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nedd1P33215 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms