Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms