Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms