Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxd10P28359 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd10P28359 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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