Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
U2af2P26369 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
U2af2P26369 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
U2af2P26369 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
U2af2P26369 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
U2af2P26369 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
U2af2P26369 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms