Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms