Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb9P20615 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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