Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp54P14576 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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