Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd4P10628 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms