Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P10404 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P10404 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P10404 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P10404 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P10404 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P10404 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P10404 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P10404 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P10404 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P10404 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P10404 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P10404 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P10404 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms