Protein–RNA interactions for Protein: P09690

Chrnb1, Acetylcholine receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb1P09690 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chrnb1P09690 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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