Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tgfb1P04202 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms