Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccl20O89093 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccl20O89093 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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