Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CcnkO88874 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms