Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfdp1O88271 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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