Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Stra6O70491 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Stra6O70491 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Stra6O70491 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Stra6O70491 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Stra6O70491 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Stra6O70491 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Stra6O70491 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Stra6O70491 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Stra6O70491 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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