Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vamp4O70480 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp4O70480 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp4O70480 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp4O70480 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp4O70480 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp4O70480 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp4O70480 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp4O70480 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vamp4O70480 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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