Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf13O54965 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rnf13O54965 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rnf13O54965 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rnf13O54965 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rnf13O54965 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rnf13O54965 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf13O54965 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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